Государственное учреждение «Государственный фармацевтический надзор в сфере обращения лекарственных средств «Госфармнадзор» создано во исполнение Указа Президента Республики Беларусь от 31 декабря 2019 г. № 499 «Об обращении лекарственных средств», приказом Министерства здравоохранения Республики Беларусь от 6 апреля 2020 г. № 386 «О создании государственного учреждения «Государственный фармацевтический надзор в сфере обращения лекарственных средств «Госфармнадзор».
Учреждение осуществляет свою деятельность в соответствии с Конституцией Республики Беларусь, законами Республики Беларусь, декретами, указами и распоряжениями Президента Республики Беларусь, иными актами законодательства Республики Беларусь, приказами Министерства здравоохранения и Уставом.